Trzy rzeczy, które mogą denaturować enzymy to temperatura, poziom pH i stężenie soli. Enzymy to białka; tak jak w przypadku wszystkich białek, enzymy działają tylko w pewnych optymalnych warunkach. Te optymalne środowiska obejmują określone zakresy temperatur, określone poziomy pH i określone stężenia soli.
Jeśli enzym nie znajduje się w optymalnym środowisku, może nie działać dobrze lub nawet wcale. Enzymy ulegają denaturacji lub zniekształceniu w nieoptymalnych środowiskach. Zdenaturowane enzymy tracą swoje naturalne trójwymiarowe złożone kształty.
Wiele enzymów nie działa dobrze w wysokich temperaturach. Wzrost temperatury na ogół sprzyja funkcji enzymu, ale w temperaturach powyżej 40 stopni Celsjusza wiele enzymów zwierzęcych przestaje działać. Zmiana poziomu pH wpływa na wiązania wodorowe, słabe wiązanie łączące części enzymu ze sobą; to zmienia kształt enzymu. Zmiany zasolenia wpływają na wiązanie grupy R w aminokwasach, blokach budulcowych wszystkich białek. Te grupy R, zwane również aminokwasowymi łańcuchami bocznymi, współdziałają ze sobą, aby wytworzyć trójwymiarowy kształt białka.
