Istnieje wiele teorii związanych z tym, dlaczego Anasazi zniknęło, ale nie ma solidnych dowodów, które dają jeden konkretny powód. Wcześniej podejrzewano, że susza pod koniec lat 1200. wypędziła je z ich długoletnich domów , ale więcej odkryć pokazało, że samo to nie wystarczałoby, by je wyprzeć.
Pomysł, że ci ludzie całkowicie zniknęli, jest również mylący. Współcześni Indianie Pueblo są bezpośrednimi potomkami tej rasy ludzi, więc nigdy tak naprawdę nie zniknęli. Dowody wskazują, że Anasazi mogli zdecydować się na odejście z powodu zbyt długiego przebywania na tym obszarze, a ziemia była wykorzystywana do granic możliwości.
