Większość teorii na temat tego, gdzie Morze Czerwone otrzymało kolorowe centrum nazwisk na czerwonym rozkwicie bakterii, który okresowo pojawia się na jego powierzchni, kierunkowe skojarzenie lub jego związek z Himyarytami, władcami Sheby. Brak historycznych rekord określa dokładny powód.
Najbardziej oczywistą odpowiedzią z trzech możliwych powodów jest bakteria trichodemium, często nazywana "trocią morską", która pływa blisko wody i ma czerwonawy odcień. To ta sama bakteria, która tworzy się w pozbawionej tlenu wodzie oceanicznej, powodując czasami "czerwoną falę".
W starożytnym świecie czerwień była jednym z wielu kolorów związanych z kierunkami. Czarny był na północy, czerwony na południu, zielony na zachodzie i biały na wschodzie. Teoria ta zakłada, że Morze Czerwone leżało na południe od starożytnego Bliskiego Wschodu.
Ostatnią teorią jest to, że morze zostało nazwane na cześć Himyarytów, ludu, który żył kiedyś nad jego brzegiem w pobliżu Jemenu i Etiopii. Himyaryci byli również powiązani z królewską własnością Sheby. "Himyer" luźno tłumaczy się na "czerwony", a Sheba jest bardzo blisko starożytnego hebrajskiego "seba" lub czerwonego. Chociaż nie ma pewności, dlaczego można je było nazwać "czerwonymi ludźmi", możliwe, że było to związane ze słynnym barwnikiem o barwie królewno-purpurowej uzyskanym z mureksowego mięczaka, który został aktywnie zebrany i przetworzony w tym obszarze. Tyryjska purpura, jedna z tej grupy barwników, jest bliższa czerwieni i plami ręce farbiarzy.