Morze Czerwone wzięło swoją nazwę od czerwonych bakterii zamieszkujących górę wody. Można to nazwać także z powodu ludzi, którzy mieszkali w jego brzegach i ze względu na kierunek, w którym w odniesieniu do starego śródziemnomorskiego sposobu określania kierunków.
Nie ma żadnego ostatecznego powodu, w jaki sposób morze to uzyskało swoje tajemnicze imię, ale wielu uważa, że może to być kombinacja wszystkich czynników. Morze zawiera specjalny rodzaj bakterii, znany jako trociny morskie. Bakteria ta znajduje się na powierzchni morza i może nadać jej nieco czerwony odcień, jeśli czas i oświetlenie są prawidłowe. Himyaryci byli grupą starożytnych ludzi żyjących wzdłuż brzegów morza. Ci ludzie byli powiązani z kolorem czerwonym, a morze mogło zostać nazwane ze względu na ich znaczenie w okolicy.
W starożytnych czasach śródziemnomorskich wskazówki były nazywane kolorami. Czarny, czerwony, zielony i biały decydowały o północy, południu, wschodzie i zachodzie. Morze Czerwone znajdowało się na południu i często było określane jako morze południa, lub Morze Czerwone w języku starożytnych kierunków.