Pogrzeb Annette Funicello został przeprowadzony w Cherished Memories Memorial Chapel w Bakersfield w Kalifornii. Była to prywatna ceremonia. Niektóre relacje mówią, że Funicello zostało pochowane w Forest Lawn Memorial Park w Hollywood Hills w Kalifornii, ale te zgłoszenia zostały zakwestionowane.
Ms. Funicello miała 70 lat, gdy zmarła na skutek powikłań związanych ze stwardnieniem rozsianym, chorobą, w której układ odpornościowy pożera osłonę nerwową. Funicello publicznie ogłosiła swoje słabe zdrowie w 1992 roku. Znaki, które mogły wskazywać, że Funicello zaczynał cierpieć na SM, były zauważalne już w 1987 roku, kiedy Funicello doznał zawrotów głowy podczas pracy z aktorem Frankie Avalonem. W tym czasie nie rozwiązała problemu.
