Protokół bezpiecznego kanału (SCP) służy przede wszystkim do przesyłania plików między hostem zdalnym i lokalnym lub dwoma hostami lokalnymi, a protokół bezpiecznego przesyłania plików (SFTP) umożliwia szerszy zakres operacji podczas przesyłania plików w sieci. Oprócz przesyłania plików SFTP może być wykorzystywany do zadań takich jak wznawianie przerwanych transferów, zdalne usuwanie plików i wyświetlanie zawartości katalogu.
W oparciu o protokół sieciowy Secure Shell (SSH), SCP został zaprojektowany w celu zapewnienia szyfrowanych kanałów do przesyłania bezpiecznych transferów danych między różnymi hostami. SCP używa Secure Shell (SSH) do przesyłania i uwierzytelniania, co zapewnia poufność podczas tranzytu.
SFTP został zaprojektowany jako ulepszone rozszerzenie SSH. Oprócz zapewnienia szyfrowanych kanałów komunikacji między komputerami, oferuje jeszcze więcej funkcji i możliwości transferu plików niż SCP. SFTP jest także bardziej niezależny od platformy niż protokół bezpiecznego kanału. Częstym błędem popełnianym przez wiele osób jest postrzeganie SFTP jako bezpieczniejszej formy standardowego protokołu FTP. To jest niepoprawne. SFTP to inny protokół, niezależny od FTP i niekompatybilny z serwerami FTP. Inną kluczową różnicą między obydwoma protokołami jest to, że SCP działa tylko na serwerach z SSH w wersji 1, podczas gdy SFTP działa tylko na serwerach z SSH w wersji 2.