Rzeki są głównym źródłem wody występującym w tropikalnych lasach deszczowych. Wiele lasów deszczowych posiada jedną dużą rzekę, która zasila cały ekosystem i wiele mniejszych rzek, które wpływają do głównej części wód, takich jak rzeka Amazon. i jej liczne dopływy.
Najsłynniejszą rzeką lasów tropikalnych jest Amazonka, która jest także największą rzeką na świecie dzięki wypuszczeniu wody o objętości 7 381 000 stóp sześciennych na sekundę. Rzeka Amazon ma szerokość od 1 do 6 mil podczas pory suchej w lesie deszczowym, ale może mieć szerokość nawet do 30 mil w okresie pory deszczowej. Jest to również druga najdłuższa rzeka na świecie i największy zlewisko.