Do czynników abiotycznych rafy koralowej należą światło słoneczne, tlen, dwutlenek węgla i woda. Czynnikami abiotycznymi są te czynniki w pobliżu rafy koralowej, które nie są żywe, ale mogą wpływać na ich zdrowie i życie.
Pomimo faktu, że czynniki abiotyczne są niebiologiczne, wciąż mogą mieć ogromny wpływ na samopoczucie rafy koralowej. Warunki, które zmieniają się z powodu globalnego ocieplenia, na przykład, mogą wpływać na stabilność całego ekosystemu, siejąc spustoszenie na rafie koralowej i otaczających obszarach. Zbyt duża zmiana czynników abiotycznych może wpłynąć na ilość światła słonecznego docierającego do rafy, co wpływa na ilość dostępnego pokarmu koralowego.