Wykorzystanie komputera w mikrobiologii obejmuje wykorzystanie w badaniach laboratoryjnych, analizie i raportowaniu, gromadzeniu i przechowywaniu danych oraz w przeprowadzaniu badań i testów. Komputery również odgrywają istotną rolę w wymianie informacji, identyfikacji nowych chorób i epidemie, opracowywanie nowych metod leczenia chorób i zakażeń oraz prognozowanie trendów.
Raporty z 1971 roku dokumentują wykorzystanie komputerów do przygotowywania raportów z wyników badań pacjentów. W 1984 r. Naukowcy zdali sobie sprawę z możliwości przeplatania mikrokomputerów wykonujących pracę laboratoryjną z większymi maszynami, tworząc sieci informacyjne między szpitalami i laboratoriami.
Komputery nadal wykonują te i dodatkowe funkcje i odgrywają większą rolę w gromadzeniu i analizowaniu danych oraz rozpowszechnianiu wyników. Naukowcy wykorzystują komputery, aby pomóc w opracowaniu i utrzymaniu eksperymentalnych kontroli, takich jak warunki środowiskowe, podczas testów. Komputery pomagają badaczom ocenić podatność lub oporność różnych szczepów na leki.
Komputery pomagają również badaczom w identyfikowaniu i analizowaniu nowych szczepów organizmów oraz opracowywaniu nowych leków do ich leczenia. Inne zastosowania obejmują opracowanie modeli komputerowych do prognozowania rozprzestrzeniania się chorób i przewidywania epidemii i epidemii.