Do skutków ubocznych fosforanu trójwapniowego należą: nudności, utrata apetytu, wymioty, zaparcia, suchość w jamie ustnej oraz zwiększone pragnienie i oddawanie moczu. Te działania niepożądane wynikają z bezpośredniego kontaktu z substancją, a nie ze spożywania pokarmów które go zawierają.
Fosforan trójwapniowy dodaje się do żywności w celu zwiększenia jej zawartości wapnia. Jest również przyjmowany jako suplement diety. Może być stosowany w przeszczepach kostnych i usuwaniu fluoru z wody. Występuje w mleku krowim i jako skała w wielu krajach, w tym w Maroku i Egipcie. Substancja jest stosowana w wielu produktach spożywczych i napojach, takich jak wina, słodycze, sery i dżemy.