Po spotkaniu z Jill Rhodes w 1992 roku, Sean Hannity ożenił się z nią w 1993 roku, pomimo sprzeciwu ze strony pastora i współpracowników. Para ma dwoje dzieci razem, od 2015 roku.
W 1992 r. Hannity pracował w Huntsville w Alabamie, gdzie miał swój popołudniowy program radiowy. Rozpoczął debatę burmistrza w mieście, gdzie spotkał się z Rodos, pisarzem dla "The Huntsville Times". Dwa z nich datowane na trzy miesiące, a kiedy Hannity przyjął ofertę na talk-radio w Atlancie w stanie Georgia, poprosił ją, aby przeprowadziła się z nim. Zgodziła się, pod warunkiem, że się ożenią.
Hannity wdała się w dyskusję polityczną z pastorem pary podczas doradztwa przedmałżeńskiego, kiedy Hannity powiedziała pastorowi, że kościół stał się zbyt liberalny, a pastor powiedział Rhodesowi, że była szalona, by poślubić Hannity. Jej współpracownicy w gazecie również zalecili, aby nie wyszła za niego z powodu swojej pracy jako radiotelegrafista. Mimo to para ta wyszła za mąż 9 stycznia 1993 roku. Hannity oświadczyła, że pastor również poślubił wielu przyjaciół tej pary, ale Hannity i Rhodes są jedynymi małżeństwami, które wciąż pozostają w związku małżeńskim.
Para ma chłopca i dziewczynę. Ich syn, Patrick, urodził się w 2005 roku. Ich córka, Merri Kelly, urodziła się w 2008 roku.