U zdrowych osób jedynym wspólnym działaniem ubocznym probiotyków jest łagodny dyskomfort związany z trawieniem, na przykład w postaci gazu, zgodnie z National Center for Complementary and Integrative Health. Jednak od 2015 r. Naukowcy nadal mają pewne wątpliwości dotyczące długoterminowego bezpieczeństwa przyjmowania probiotyków, a dalsze badania są konieczne. Przyjmowanie probiotyków może powodować ciężkie zakażenia u osób, które niedawno przeszły operację, są krytycznie chore lub mają osłabiony układ odpornościowy.
Nie wszystkie produkty probiotyczne zawierają te same nici bakteryjne, co oznacza, że niektóre produkty są bezpieczniejsze od innych, zauważa National Center for Complementary and Integrative Health. Na przykład wyniki jednego z badań wskazały, że specyficzna nić Lactobacillus wydaje się być bezpieczna dla zdrowych osób powyżej 65 roku życia, ale badanie to nie jest wystarczającym dowodem, że stosowanie probiotyków w ogóle jest bezpieczne u osób w podeszłym wieku.
Pomimo twierdzeń, że probiotyki są pomocne w zarządzaniu szerokim zakresem warunków zdrowotnych, niewiele jest dostępnych dowodów naukowych, ostrzega National Center for Complementary and Integrative Health. Istnieją pewne dowody na to, że suplementy probiotyczne zapobiegają biegunce u osób przyjmujących antybiotyki lub mających określone infekcje. Istnieją również dowody na to, że probiotyki mogą zmniejszać objawy zespołu jelita drażliwego. Konieczne są dalsze badania w celu ustalenia, które konkretne probiotyki są najskuteczniejsze w zapewnianiu tych korzyści i ile pacjenci muszą przyjąć, aby osiągnąć takie korzyści.
