Zaparcie nie jest efektem ubocznym związanym z formułą soi. Formuła soi to leczenie zaparć u niemowląt. National Institute of Health klasyfikuje preparat dla niemowląt sojowych jako substancję o minimalnym znaczeniu w odniesieniu do działań niepożądanych.
Oprócz stosowania w zaparciach, dla niemowląt z alergiami na mleko przepisana jest soja. Trzy procent niemowląt w Stanach Zjednoczonych ma alergię na mleko, a większość z nich wyrasta z nich. Mleko sojowe jest najczęstszą metodą leczenia tej alergii i jest odżywczym odpowiednikiem mleka krowiego. Formuła soi stanowi 12 procent wszystkich sprzedaży formuł w Stanach Zjednoczonych od 2014 roku, co stanowi 50-procentowy spadek sprzedaży od szczytu w 1999 roku.
Jedynym udokumentowanym skutkiem ubocznym formuły sojowej u ludzi jest jej wpływ na alergików sojowych. Badania na zwierzętach wykazują korelację między wysokim spożyciem soi i wczesnym dojrzewaniem z powodu zwiększonego poziomu estrogenu, ale to odkrycie nie jest potwierdzone u ludzi. Narodowy Instytut Zdrowia i Departament Rolnictwa Stanów Zjednoczonych cytują długoterminowe badania jako dowód, że formuła soi jest bezpieczną alternatywą dla mleka krowiego, chociaż obie agencje zachęcają rodziców do karmienia niemowląt mlekiem matki zamiast formuły, gdy tylko jest to możliwe.