Podczas gdy krokodyle są najniebezpieczniejsze w płytkiej wodzie i przy linii brzegowej, mogą nadal atakować pod wodą. Według CrocBITE krokodyle mają w gardle specjalny zawór, który utrzymuje wodę na zewnątrz, umożliwiając im otwarcie ich usta i ukąszenia, nawet gdy są całkowicie zanurzone.
Krokodyle zwykle atakują zdobycz w pobliżu powierzchni wody i atakują w obszarach bardzo blisko linii brzegowej. Chociaż istnieją pewne dowody na to, że krokodyle rzadziej postrzegają ludzi jako ofiary, gdy są pod wodą, nadal mogą atakować i są uważani za poważne zagrożenie dla nurków i zanurzonych pływaków.