Anakondy oddychają przez nozdrza znajdujące się tuż nad ich pyskami. To umieszczenie jest ważne dla ich drapieżnych nawyków, ponieważ mogą one oddychać, podczas gdy w większości zanurzają się w wodzie przed podkradaniem się na swoją ofiarę. Raz w uderzającej odległości wynurzają się z wody, aby owinąć się wokół swojej ofiary i udusić ich.
Niektóre gatunki anacondas mogą przebywać pod wodą bez oddechu przez około 10 minut. Ta umiejętność pozwala na szybką nawigację po wodach i jeszcze więcej ukrytych manewrów karmienia. Anakondy czasami udają się na ląd, aby złapać swoją zdobycz, ale wolą pozostać w wodzie lub w jej pobliżu.