Aligator amerykański, znany naukowcom jako Alligator mississippiensis, znajduje się na szczycie łańcucha pokarmowego. Nazywany drapieżnikiem wierzchołkowym, dorośli aligatory amerykańscy żywią się praktycznie każdym innym stworzeniem, które dzieli ich środowisko, ale nie boją się niczego oprócz ludzi i większych aligatorów. Jednak młode nie są tak bezpieczne, a wiele aligatorów dziecięcych jest spożywanych przez różne wodne drapieżniki.
Ryby i żółwie są najważniejszą zdobyczą dla większości aligatorów, ale nie są wybrednymi konsumentami. Innymi popularnymi gatunkami drapieżników są węże, żaby, ropuchy, salamandry, ptaki, jaszczurki, bobry, szopy pracze, nutrie, szczury, skorupiaki, mięczaki, owady i mniejsze aligatory. Młode aligatory żywią się mniejszą zdobyczą, w tym owadami, żabami i rybami. Aligatory w każdym wieku przystosowują się do lokalnych źródeł żywności, ale są mięsożerne i nie jedzą roślinności.
Ptaki brodzące, węże, duże ryby, żółwie, szopy, lisy i większe aligatory polują na młode aligatory. W miarę wzrostu młode aligatory dodają coraz większej ofierze do listy dopuszczalnych pokarmów. Jednocześnie aligatory obawiają się coraz mniej drapieżników.
Aligatory stanowią ważną część ekosystemów słodkowodnych, ponieważ pomagają utrzymać równowagę między populacjami małych zwierząt. Dodatkowo, żółwie i niektóre inne zwierzęta składają jaja w gniazdach aligatorów.