Mikroskopy do mikroskopowania, zwane również mikroskopami stereoskopowymi, są instrumentami naukowymi używanymi do uzyskiwania trójwymiarowych obrazów uzyskanych próbek. Mikroskop trenuje dwie różne soczewki na próbce w celu uzyskania obrazu.
Mikroskopy do preparowania mają zalety i wady. Są to jedyne mikroskopy, które mogą wytwarzać obrazy trójwymiarowe i mają lepszą głębię ostrości w porównaniu do typowych mikroskopów złożonych. Ich trójwymiarowe obrazy mogą być przydatne w określaniu dokładnej lokalizacji i funkcji obiektów. Mają jednak małe powiększenie. Zapobiega to wyświetlaniu bardzo szczegółowych obrazów, ale pozwala na oglądanie większych części obiektu w tym samym czasie.