Mikroskop porównawczy jest wyspecjalizowanym mikroskopem, który pozwala na porównanie różnych materiałów. Opracowany przez Calvina Goddarda w latach dwudziestych XX wieku, mikroskopy te są dziś często używane przez FBI i inne egzekwowanie prawa w celu określenia podobieństw obiektów takich jak włosy i wystrzeliwana amunicja.
Mikroskopy porównawcze to zasadniczo dwa oddzielne mikroskopy połączone mostem, który zawiera pojedynczą soczewkę. Dwa podobne obiekty mogą być umieszczone na przeciwnych etapach i mogą być oglądane jednocześnie w tym samym polu widzenia. To bardzo pomaga egzaminatorom porównywać dwa podobne materiały bez potrzeby przemieszczania się między dwoma oddzielnymi mikroskopami.
