Organizmem patogennym jest bakteria, grzyb, prion lub wirus, który przeżywa, żywiąc się żywicielem. Organizm chorobotwórczy zwykle powoduje chorobę w organizmie gospodarza.
Chociaż większość bakterii nie powoduje chorób u ludzi, osoby z tłumionym układem odpornościowym są bardziej podatne na oportunistyczne patogeny, które często dobrze się rozwijają w ciepłym, wilgotnym środowisku ludzkiego ciała. Naturalne reakcje organizmu na inwazyjne patogenne organizmy obejmują wzrost temperatury ciała. Wiele z tych naturalnych reakcji hamuje zdolność tych organizmów do życia i rozmnażania. Aby przetrwać w konfrontacji z antybiotykami, niektóre szczepy bakterii ewoluowały i rozwinęły zdolność do opierania się najczęściej przepisywanym rodzajom leków stosowanych w celu pozbycia się ciała tych patogenów.