Wewnętrznie rośliny są wyposażone w systemy immunologiczne chroniące przed patogenami, a wiele z nich produkuje chemikalia, które chronią przed atakami potencjalnych drapieżników, takich jak chrząszcze, robaki i inne owady. Niektóre rośliny mają ostro zakończone osty i igły na ich łodygach i gałęziach, aby uczynić je nieatrakcyjnymi (i niejadalnymi) do polowania, podczas gdy inne wyrastają z kolorowych kwiatów, które z pewnością są przyjemne dla oka, ale co ważniejsze, ostrzegają drapieżników, że rośliny mają jad albo toksyczne chemikalia.
Podobnie jak ludzie, rośliny mają układ odpornościowy, który chroni je przed atakiem ze strony patogenów. Tak jak hormony i substancje chemiczne chronią ludzi przed wirusami, bakteriami i innymi chorobami, układ odpornościowy roślin zawiera substancje chemiczne i składniki odżywcze, które zwalczają ataki chorób i pasożytów. Wiele roślin wytwarza chemikalia potrzebne do budowy systemów obronnych w najwcześniejszych etapach życia, podczas gdy inne zaczynają wytwarzać te środki po spotkaniach z obcymi patogenami.
Oprócz aktywnych systemów odpornościowych rośliny wydzielają specjalne związki chemiczne, które często są bezzapachowe i niewidoczne dla ludzkiego oka, ale mogą być widoczne i wyczuwane z daleka przez ptaki, owady i robaki. Niektóre rośliny, zamiast trzymać się z dala od drapieżników, produkują słodkie i syropowate substancje, które przyciągają mszyce, robaki i inne organizmy; te syropy są spożywane przez te organizmy i zawierają toksyny, które ostatecznie je zabijają.
