Glikogen występuje głównie w wątrobie i mięśniach szkieletowych ludzkiego ciała. National Center for Biotechnology Information donosi, że wątroba ma 10% stężenie glikogenu w masie w porównaniu do 2 procentowe stężenie w mięśniach szkieletowych. Jednak mięśnie szkieletowe zawierają większość glikogenu w organizmie ze względu na ich ogólną masę.
Glikogen jest magazynującą formą glukozy, którą organizm może łatwo metabolizować w celu dostarczenia wymaganej glukozy dla energii. Znaczne ilości glukozy są przechowywane w formie glikogenu, a nie tłuszczu, dla łatwej konwersji do glukozy w celu dostarczania energii między posiłkami. Glikogen jest zatem rezerwą glukozy, a także środkiem utrzymującym równowagę glikemii przez ludzkie ciało.
Ciało może łatwo metabolizować glikogen, nawet w nieobecności tlenu, co powoduje, że glikogen jest ważnym źródłem energii podczas forsownych lub nagłych działań. Glikogen przechowywany w mięśniach jest rozkładany przez komórki mięśniowe w celu wykorzystania w mięśniach, podczas gdy glikogen przechowywany w wątrobie jest rozkładany do wykorzystania w pozostałej części ciała, w tym w układzie nerwowym. Natomiast energia przechowywana w postaci tłuszczu nie jest łatwo dostępna. Ilości glikogenu przechowywane w mięśniach, wątrobie i czerwonych krwinkach zależą od treningu organizmu, jego podstawowej przemiany materii i indywidualnych nawyków żywieniowych.
