Wszystkie trzy rodzaje archaebakterii używają innego rodzaju metody do tworzenia ATP, które obejmują konwersję metanu w ATP przez metanogeny, użycie oddychania tlenowego lub konwersję energii świetlnej przez halofile i teofofile przekształcające siarkowodór aby stworzyć ATP. Tego typu bakterie są przechowywane w klasie osobno ze względu na warunki, które często zapełniają. Archaebakterie to najstarsze znane żywe organizmy na świecie.
Metanogeny są unikalne w tym, że nie mogą istnieć w środowisku natlenionym. Bakterie te znajdują się głównie w obszarach takich jak torfowiska, ścieki, a nawet jelita. Częste bakterie nie mogą przetrwać w obszarach o wysokiej zawartości soli, ale w klasyfikacji archebakterii istnieje wyjątek. Halofile żyją w środowiskach o wysokiej zawartości soli, takich jak Morze Martwe czy Wielkie Słone Jeziora. Halofile, w przeciwieństwie do innych rodzajów archeonów, mogą zmienić rodzaj procesu wytwarzania energii, z którego korzystają, od oddychania tlenowego do fotosyntezy z pigmentem o nazwie bakteriorodopsyna. Thermophile żyją w obszarach o wysokiej kwasowości i wysokiej temperaturze. Mogą wytrzymać temperatury do 230 stopni Fahrenheita, co sprawia, że wulkaniczne otwory wentylacyjne i otwory hydrotermalne są idealnym miejscem do ich rozwoju. Ich formy mogą wytrzymać pH tak niskie, jak 2. Tego typu bakterie, pomimo ich wyjątkowości są klasyfikowane jako prokrywy.
