Aligatory komunikują się ze sobą, emitując głębokie, głośne dźwięki ryczące, które docierają do 165 jardów. Kiedy aligatory są konkury, wydają mruczący kaszel, określany jako chumpfs. Aligatory zaczynają komunikować się z matkami, gdy są jeszcze w swoich jajach, emitując ostre, jęczące odgłosy, aby ogłosić ich przybycie, kiedy przygotowują się do wyklucia.
W okresie godowym aligatory płci męskiej wchodzą w interakcje z kobietami, wychylając głowy z wody jako akt rycerskości, a także emitując piżmowe aromaty z gruczołów znajdujących się na ich dolnej szczęce. Kobiety przyciągają samców, wytwarzając ciche, ciche warczenie. Inną formą niewerbalnej komunikacji między aligatorami jest uderzenie głową, zachowanie, w którym samiec otwiera usta i uderza swoją szczęką, tworząc trzaskający dźwięk w wodzie. Mężczyźni angażują się w head-slapping, aby wysyłać ostrzeżenia potencjalnym drapieżnikom i oznaczać ich terytoria.
Aligatory emitują również dźwięki o niskiej częstotliwości, wykonując tańce wodne. Podczas tańca wodnego mężczyzna kołysze swoje ciało, aby wytworzyć wibracje, których ludzie nie usłyszą. Wibracje wytwarzają bąbelki i zmarszczki w wodzie wyczuwane przez inne aligatory. Taniec wodny często towarzyszy uderzaniu głową.
Aligatory obu płci przyjmują podwyższone pozycje, aby ustanowić dominację i zintegrować grupy. Kiedy postawa aligatora jest podniesiona, ciało jest całkowicie proste, a większość jego długości znajduje się na wierzchu wody.