Kanarki męskie i żeńskie wyglądają bardzo podobnie i trudno jest zidentyfikować płeć ptaka; istnieje jednak kilka sposobów, aby dowiedzieć się, czy kanarek jest mężczyzną czy kobietą. Ogólnie rzecz biorąc, jasne pióra oznaczają samca, a matowe pióra oznaczają samicę.
W niektórych przypadkach żeński kanarek wykazuje zachowanie podczas zagnieżdżania, gromadząc przedmioty, aby zbudować gniazdo. Jeśli kanarek śpiewa regularnie, oznacza to mężczyznę. Badanie fizycznej płci ptaka jest definitywnym sposobem określenia, czy jest to mężczyzna czy kobieta. Samiec ma niewielki wyrostek, a samica nie.