Istnieją trzy sposoby rozróżnienia między kanarkami męskimi i żeńskimi: kontrola narządów płciowych, wygląd koloru i wczesna piosenka. Hodowca Sebastian Vallelunga uważa, że sprawdzanie dojrzałego płciowo kanarka jest metodą praktycznie niezawinioną, samiec ma pseudopipę, która wystaje z otworu wentylacyjnego, podczas gdy samica ma okrągłą kopułę wystającą ponad otwór wentylacyjny. Samice gotowe do hodowli mają równy, torpedowy brzuch, który zwęża się z jednej strony.
Najbardziej oczywistym i wiarygodnym wskaźnikiem płci jest to, czy kanar składa jajo. Niektórzy hodowcy wolą oddzielić płeć wcześniej, aby promować lepszy rozwój pieśni wśród samców, nawet zanim pisklęta się uratują. Badanie wczesnej piosenki i analiza w oparciu o kolory są pomocnymi narzędziami.
Wczesna piosenka kanarka, znana jako pod-piosenka, to senny tryl, podczas którego męski gardło się napełnia, odzwierciedlając późniejsze zachowanie dorosłych. Podczas kolejnej fazy nauki śpiewania, piosenka z tworzywa sztucznego, mężczyzna zaczyna integrować dorosłych fragmenty i frazy w swojej piosence, czyniąc go bardziej wiarygodnym wskaźnikiem płci.
Wygląd koloru jest mniej spójną metodą, w której różnice między gatunkami są lepsze dla kanarków, które są blisko spokrewnione lub należą do tego samego szczepu. Mówiąc ogólnie, Vallelunga uważa, że jaśniejszy kanarek to kobieta.
