Klasyfikacja taksonomiczna muchy domowej, której nazwa naukowa to musca domestica, jest następująca: królestwo Animalia, typ Arthropoda, klasa Insecta, rząd Diptera, sekcja Schizophora, rodzina Muscidae, rodzaj Musca i gatunek Musca domestica. Muchy domowe są najczęstszymi muchami i najczęściej występują w umiarkowanych regionach.
Ta klasyfikacja wskazuje, że mucha domowa jest zwierzęciem bezkręgowym. Jest stawonogiem, co oznacza, że ma egzoszkielet i nogi połączone. Klasa Insecta oznacza, że mucha domowa to zwierzę z głową, klatką piersiową i brzuchem oraz trzema parami połączonych nóg.
Mucha występuje na całym świecie, ale rozwija się tam, gdzie znajdują się ludzie. Dzieje się tak dlatego, że ludzkie odpady są idealnym środowiskiem do odkładania jaj i rozwoju larw.
