Broń używana podczas ataku na Pearl Harbor zawierała bomby, torpedy, karabiny maszynowe i działa przeciwlotnicze. Japońskie bomby i torpedy zostały zrzucone przez liczne samoloty, w tym bombowce B5N2 i bombowce nurkujące Aichi D3A1. Japończycy również używali A6M Model 21 Zeros do ostrzeliwania lotnisk wokół Pearl Harbor.
Większe bombowce B5N2 były wyposażone w pojedynczą torpedę typu 91 Model 2. Te torpedy były wyposażone w drewniane płetwy wokół śmigieł, co pomogło im działać na płytkiej wodzie w porcie. Każda torpeda ważyła około 1847 funtów i miała głowicę o wadze 452 funtów. Bombowiec B5N2 miał także karabin maszynowy kalibru 30 umieszczony w ogonie samolotu, który strzelcy używali do strafienia celów, gdy bombowiec przeleciał nad głową.
Z 89 bombowców w pierwszej fali, 40 z nich miało torpedy typu 91 Model 2. Pozostałe 49 bombowców miało wielokrotne bomby Type 91 Model 5, które ważyły 1,763 funta. Bomba Model 5 miała zdolność przebijania się przez wiele pokładów docelowego statku, gdy spadła z dużej wysokości.
Mniejsze bombowce nurkujące Aichi D3A1 miały jedną bombę lądową typu 98 o wadze 551 funtów. Bomby zostały przeznaczone specjalnie do użycia podczas ataku na pas startowy i bazę lotniczą wokół Pearl Harbor. Po tym, jak bombowce nurkujące zrzuciły bomby, dołączyły do Zero A6M Model 21 w ostrzeliwaniu celów naziemnych za pomocą karabinów maszynowych i dział 20-milimetrowych.
