Nikaragua to największy kraj w całej Ameryce Środkowej, o łącznej powierzchni 81 008,2 mil kwadratowych. Około 74.558 mil kwadratowych kraju to ziemia. Nikaragua ma długą granicę z Hondurasem na północy i krótszą granicą z Kostaryką na południu. Ma linię brzegową obejmującą 565 mil wzdłuż północnego Pacyfiku na zachodzie i Morza Karaibskiego na wschodzie.
Dwa największe jeziora słodkowodne w Ameryce Środkowej, Lago de Managua i Lado de Nicaragua znajdują się w Nikaragui. Río San Juan przenosi wodę z Lago de Nicaragua na wschód przez cały kraj, ostatecznie odkładając jej wody w Morzu Karaibskim. Niziny przebiegają przez basen Río San Juan, gdzie znajdują się tropikalne lasy deszczowe i sawanny. Nikaraguański przesmyk odnosi się do ziemi położonej pomiędzy Lago de Nicaragua a Morzem Karaibskim. Río Tipitapa przenosi wodę z Lago de Managua na południe do Lago de Nicaragua. Najwyższe wzniesienia w kraju znajdują się w obszarze zwanym środkową górą, który znajduje się w północno-wschodniej części kraju. Zachodnia część kraju znajduje się wzdłuż uskoku dwóch płyt tektonicznych.