Jest kilka drapieżników konika morskiego, w tym krab, płaszczka, tuńczyk i pingwin. Koniki morskie nie mają naturalnego mechanizmu obronnego i nie pływają bardzo dobrze - dwa czynniki, które je pozostawiają otwarte do drapieżnictwa i polegania na ich środowisku w celu ochrony.
Rozmiar konia morskiego to jedna rzecz, która pomaga go chronić, ponieważ nawet największy konik morski mierzy zaledwie 8 cali wysokości, a konik morski może zmieniać kolory w zależności od środowiska, dzięki czemu może ukradkiem ukrywać się przed drapieżnikami. Mimo to jest bardzo podatny na bycie przez inne stworzenia w morzu. Chociaż męski konik morski może urodzić 1500 koników morskich lub więcej jednocześnie w ciążach trwających od 10 do 25 dni, przeżyje tylko 1 procent dzieci.