Środki antyseptyczne są nakładane na skórę, aby zmniejszyć możliwość infekcji. Wspólne środki antyseptyczne obejmują pocieranie alkoholu, kwasu borowego, nadtlenku wodoru i jodu. Powszechnie stosowane w antyseptycznych ręcznikach rodzina substancji znanych jako czwartorzędowe związki amoniowe są również uważane za antyseptyki. Przykładami są chlorek benzalkoniowy i chloroheksydyna.
Chlorek benzalkoniowy jest popularnym aktywnym składnikiem dostępnych bez recepty środków antyseptycznych. Ponadto nadtlenek wodoru, 6-procentowa wytrzymałość, jest powszechnym antyseptycznym środkiem używanym do leczenia ran i cięć. Może być również stosowany jako płyn do przemywania oczu o mniejszej mocy. Przy stężeniach większych niż 50 procent substancja ta jest używana do sterylizacji narzędzi chirurgicznych.