Według American Society of Microbiology, antyseptyki działają poprzez zmianę pH środowiska bakterii, dzięki czemu środowisko nadaje się do zamieszkania. Od kiedy mikroorganizmy dostosowują się do swoich środowisk, antyseptyki muszą działać szybko, aby zabić bakterie, zanim będą miały szansę się przystosować.
Ciało jest w stanie naturalnie zwalczyć większość rodzajów bakterii. W rzeczywistości jest to narażenie na bakterie, które pomaga organizmowi budować odporność na niego. Badania wskazują, że stosowanie antybiotyków, antyseptyków i innych produktów zabijających zarazki u dzieci jest silnym czynnikiem przyczyniającym się do rozwoju alergii w późniejszym życiu.
Według Centers of Disease Control and Prevention, jednym z największych problemów w medycynie jest grupa mikroorganizmów, które budują odporność na środki antyseptyczne i antybiotyki. Ze względu na szybki czas mutacji i proliferacji, istnieje obawa, że bardzo mała kolonia bakterii, która jest odporna na środki antyseptyczne i antybiotyk, może szybko stać się dużą kolonią. Bakterie takie jak to prawdopodobnie powodują nową formę patogenu, który ma naturalną odporność na współczesną medycynę. Działa to tak samo, jak osoba, która przyjmuje tylko połowę swoich antybiotyków, co powoduje, że naukowcy i lekarze nazywają superbakteriami, które stały się odporne na antybiotyki.
