Nawozy powodują szkody w środowisku poprzez zanieczyszczenie ziemi i wód, zagrażając zdrowiu organizmów, które zamieszkują te przestrzenie. Życie w wodzie może ucierpieć, gdy poziom tlenu w wodzie spadnie poniżej normy.
Nawozy często nie zawierają minerałów, które są zdrowe dla środowiska. Z biegiem czasu mogą uszkodzić glebę. Nawozy nie tylko mogą pozostawić glebę mniej bogatą w składniki odżywcze, ale mogą również przedostawać się do żywności przeznaczonej do spożycia, stwarzając zagrożenie dla zdrowia ludzi. Nawozy niszczą mikroorganizmy, które są korzystne dla gleby i życia zależnego od jej wzrostu, w tym roślin i innych organizmów.
Efekty stosowania nawozów mogą być długotrwałe i trudne w zarządzaniu. Kilka rozwiązań uszkodzeń nawozów jest możliwych i można je włączyć do rolnictwa domowego i korporacyjnego. Należą do nich mniej nawozów lub zamiana na nawozy organiczne i nietoksyczne.
Kompostowanie to kolejna opcja. Przed posadzeniem należy wykonać kilka podstawowych badań gleby, aby określić, czy podłoże nadaje się do wzrostu roślin, ponieważ zdrowsza gleba sprzyja wzrostowi. Technika zwana integracyjnym zwalczaniem szkodników jest protokołem stosowanym do zwalczania szkodników w ogrodzie lub w gospodarstwie rolnym oraz do zwiększania wzrostu roślin bez stosowania nawozów, które niszczą środowisko.