Wylesianie redukuje recykling wody z ziemi do atmosfery iz powrotem nawet o 75 procent. Hydrosfera składa się z różnych form wody na Ziemi, a wylesianie radykalnie zmienia ziemską wodę zawartość poprzez zmniejszenie parowania i wilgotności gleby.
Wylesianie wpływa na hydrosferę, zwiększając powódź. Kiedy drewno znika z zalesionego obszaru, powodzie wzrastają z powodu zmniejszonej liczby przeszkód w wodzie. Ma to wpływ na jakość wody i stabilność gleby. Powódź zmienia bieg rzek i innych zbiorników wodnych. Oddziaływanie zmian w hydrosferze na układy klimatyczne również pozostaje w fazie badań.
W dżungli amazońskiej, 75 procent wody, która ląduje w deszczu, wypływa z powrotem do atmosfery lub wyparowuje, ponownie spadając w postaci deszczu. W lesie deszczowym jeden akr ponownie wysyła około 76 000 litrów wody z powrotem do atmosfery, tworząc chmury, które ponownie unoszą się i tworzą deszcze. To właśnie recykling nadaje lasowi deszczowemu wysoką charakterystykę wody. Wylesianie w lesie deszczowym znacznie zakłóca ten cykl. Gleby wysychają, mniej wody wraca do atmosfery, a deszcz pada mniej znacząco.