Według strony internetowej Ośrodka toczniowego Johna Hopkinsa, komórkami płaskimi są najczęściej zanieczyszczenia; strona internetowa Uniwersytetu w Utah potwierdza i wskazuje w szczególności na zanieczyszczenie skóry i zewnętrznej cewki moczowej. Zanieczyszczenia mogą dostać się do próbek medycznych przez zmywanie rąk lub genitaliów, a nie ze zbierania moczu w średnim strumieniu, informuje Informed Health Online.
Komórki płaskokomórkowe są płaskimi, przypominającymi skalę komórkami, które pokrywają wiele obszarów ciała ludzkiego, w tym skórę, według portalu About.com. Strona internetowa Cytology Stuff stwierdza, że można je znaleźć na błonach śluzowych narządów płciowych i trójkącie pęcherza moczowego. W większości przypadków komórki nabłonka znajdujące się w próbkach moczu są po prostu wynikiem zanieczyszczenia z narządów płciowych z powodu nieumiejętnego przechwytywania moczu w połowie strumienia. Naciśnięcie przykładowego kubka na genitalia może przenosić komórki z zewnątrz ciała do zebranego moczu.
Od czasu do czasu płaskonabłonkowe komórki są zrzucane z wewnętrznej powłoki pęcherza i dlatego są nieuniknione.
Komórki płaskokomórkowe mogą również pojawiać się w próbkach moczu z powodu choroby. U pacjentów z rakiem płaskonabłonkowym próbki moczu mogą zawierać nietypowe komórki łuskowate. Guzy w obszarze moczowo-płciowym zrzucają te rakowe komórki do strumienia moczu. Te nienormalne komórki mogą nie mieć jądra lub mieć nietypowe kształty.