Podczas swojej pierwszej wyprawy Zebulon Pike opuścił St. Louis, Mo. i zbadał rzekę Missisipi aż do jeziora Leech Lake i Sandy Lake w stanie Minnesota, a podczas swojej drugiej wyprawy Pike podróżował na zachód, aby zbadać źródła Czerwona Rzeka i Rzeka Arkansas, część terytorium nowo nabytego nabytku Luizjany. Szczyt Pike'a w Kolorado, po którym wspinał się częściowo, nosi jego imię.
W sierpniu 1805 r. generał James Wilkinson, dowódca armii Stanów Zjednoczonych, wysłał Pike'a w górę Missisipi z zadaniem odkrywania jego górnego biegu. Pike, a następnie porucznik, poprowadził dwudziestu ludzi do Minnesoty. Spędzili tam zimę i podpisali traktat z Indianami Sioux, ale nie znaleźli źródła rzeki.
Wilkinson wysłał Pike'a z St. Louis ponownie w lipcu 1806 roku. Tym razem podróżował aż do dzisiejszego Pueblo, Co., gdzie badał góry i próbował wspiąć się na szczyt Pike's. Potem skręcił na południe, a on i jego ludzie zbudowali mały fort na brzegu rzeki Rio Grande. Ponieważ było to wówczas terytorium hiszpańskie, zostali zatrzymani przez hiszpańskich żołnierzy, którzy zabrali ich najpierw do Meksyku, zanim wrócili do Stanów Zjednoczonych.
Do tego czasu generał Wilkinson był zamieszany z Aaronem Burrem w spisek mający na celu stworzenie odrębnego narodu na południowym zachodzie. Pike był krótko podejrzany o bycie zaangażowanym, ale potem usunięty. Później awansował na majora, a następnie na generała. Zmarł prowadząc amerykański atak na York, teraz Toronto w Kanadzie, w 1813 roku.