Wschodnie żółwie pudełkowe mają szeroką i zróżnicowaną dietę, składającą się z owadów, roślin i grzybów. Ta zróżnicowana dieta i twarda struktura pokarmowa pozwalają żółwiom zachować przetrwanie nawet wtedy, gdy ich ulubione źródła pożywienia nie są dostępne, pomoc w pomyślnym rozwoju gatunku pomimo jego powolnej dojrzałości płciowej i małej liczby potomstwa.
Żółwie pudełkowe nie są szczególnie wybrednymi konsumentami i mają solidne układy trawienne. Jako młode osobniki ich diety składają się głównie z owadów, w tym ślimaków i robaków. Gdy dojrzewają, wschodnie żółwie pudełkowe bardziej grawitują w kierunku materii roślinnej jako głównego źródła pożywienia, chociaż nadal cieszą się sporadycznymi owadami. Zarówno młode, jak i dojrzałe wschodnie żółwie pudełkowe zużywają padlinę lub martwe zwierzęta, gdy są dostępne. Spożywają duże ilości jagód, owoców i substancji roślinnych. Wschodni żółw morski również je grzyby i jest w stanie bezpiecznie trawić wiele gatunków grzybów, które są toksyczne dla ludzi i innych zwierząt.
Ci, którzy rozważają przyjęcie wschodnich żółwi jako zwierząt domowych, powinni podawać im taką samą, zróżnicowaną dietę, którą spożywają na wolności, aby zapewnić im zdrowie i radość. W przeciwnym razie mogą wystąpić niedobory witamin i minerałów, powodujące deformacje, choroby i śmierć. Istotne jest również wybranie żółwika domowego jako zwierzę domowe, aby uniknąć narażenia go na niebezpieczeństwo w środowisku naturalnym.