Aligatory nie mają zewnętrznych uszu. Jednak aligatory mają małe szczeliny za oczami. Szczeliny pomagają aligatorom słyszeć, wysyłając fale dźwiękowe do ich wewnętrznych uszu.
Aligatory nad wodą mają podobne zdolności słyszenia do ptaków, jaszczurek i innych zwierząt bez zewnętrznych uszu. Słyszenie aligatora jest równe złotym rybom, a anatomia uszu aligatorów zapewnia im wyjątkowy słuch podczas zanurzenia pod wodą. Aligator zaczyna słyszeć, gdy wibracje przemieszczają się przez czaszkę do bębenka. Nad wodą i pod wodą aligatory są najbardziej wrażliwe na dźwięki o częstotliwości około 800 Hz, co stanowi zasięg ćwierków wytwarzanych przez wylęgowe aligatory dla dzieci.