Wszystkie nietoperze widzą. Gatunki Microbat mają ogólnie słabo rozwinięte oczy i słabą ostrość wzroku, ale większość gatunków megabatowych ma doskonały wzrok, a nawet widzenie w kolorze.
Niektóre nietoperze używają echolokacji do chwytania zdobyczy. Nietoperze emitują ultradźwięki, które odbijają się od nich, pozwalając nietoperzowi uzyskać obraz otoczenia. Nietoperze, które używają echolokacji mają zazwyczaj gorsze widzenie, ale wykorzystują swoje oczy do poruszania się poza zasięgiem ich echolokacji. Nocne i jaskiniowe nietoperze przystosowały się do użycia bardzo słabego światła, a niektóre gatunki mogą nawet widzieć światło ultrafioletowe.