Komórki roślinne z cebulkowej cebulki nie mają chloroplastów, ponieważ ta część rośliny rośnie pod ziemią, przez co nie jest w stanie absorbować światła potrzebnego do fotosyntezy. Większość podziemnych struktur cebulkowych i bulwowych w roślinach nie ma chloroplasty z tego powodu.
Chociaż komórki znajdujące się na samej górze żarówki, które wyglądają przez glebę, mogą zawierać chloroplasty, główną funkcją tych komórek jest ochrona roślin przed szkodliwymi patogenami w glebie i magazynowanie energii. Te funkcje są możliwe dzięki ścianie komórkowej, błonie komórkowej, cytoplazmie, jądrze komórkowym i dużej próżni komórki.
Mikroskopia świetlna powoduje, że jądro komórki cebuli jest widoczne na krawędzi cytoplazmy. W próżni jest widoczny w środku komórki. Ta wakuola jest przezroczysta w komórkach białej cebuli, co czyni je niewidocznymi dla mikroskopii świetlnej, o ile nie są wybarwione. Komórki czerwonej cebuli są naturalnie zabarwione i nie wymagają dodawania środka barwiącego.
Najlepsze próbki do oglądania przez mikroskop optyczny przygotowuje się z cienkich plasterków małej, jędrnej cebuli. Orientacja komórek pod mikroskopem świetlnym może zwiększyć lub zmniejszyć ich widoczność. Im więcej światła może przejść, tym lepsza rozdzielczość.
