Protozoa żyją w morzach, rzekach, jeziorach, stawach, gnicie i glebie. Woda jest wymogiem dla ich środowiska i może istnieć w różnych regionach, w których jest obecna.
Pierwotniaki żyjące w słonej wodzie nie wymagają wakuoli, które są strukturami w cytoplazmie, które funkcjonują w wydzielaniu wewnątrzkomórkowym. Stężenie soli w komórce jest podobne do stężenia w wodzie morskiej i nie ma potrzeby kurczenia się i opróżniania płynów. Pierwotniaki, które posiadają te struktury i żyją w mniej słonych warunkach, pustą wodę przez pory w membranie i nadmiar płynu dostaje się do komórki.
