Według Smithsonian National Zoological Park, aligatory mają w sumie od 74 do 80 zębów w ustach. Kiedy zęby w ustach aligatorów ulegają zużyciu, zostają zastąpione nowymi zębami .
Średni aligator może wzrosnąć pomiędzy 2000 a 3000 zębów w ciągu swojego życia. Jednym ze sposobów odróżnienia aligatorów od krokodyli jest patrzenie na ich zęby. Dolny czwarty ząb w dolnej szczęce aligatora mieści się zgrabnie w gnieździe w górnej szczęce. Zęby te nie są widoczne, gdy usta aligatora są zamknięte. Krokodyle nie mają tego zęba.
Aligatory mają wyjątkowo silne mięśnie żuchwy, które umożliwiają im gryzienie i chwytanie ofiary, w tym ryb i ssaków.
