Huragany mogą dewastować zalesione ekosystemy i usuwać wszystkie foliacje z drzewostanów leśnych, i mogą tak drastycznie zmienić siedliska zwierząt, że w rezultacie cierpią miejscowe populacje zwierząt. Zagrożone gatunki w siedliskach tropikalnych, ujściach rzek i nadbrzeżnych są szczególnie zagrożone, gdy uderzą huragany.
Wiatry z huraganów zapewniają najbardziej widoczny wpływ na środowisko. Latanie nad lasem deszczowym po huraganie często ujawnia, że warstwa z baldachimem całkowicie zniknęła, co ma wpływ na życie ptaków i zwierząt, które wcześniej wykorzystywały obszar bezpośrednio pod tym korpusem jako swoje miejsce zamieszkania. Obszary leśne, takie jak mokradła i bagna, ulegają znacznym zniszczeniom, gdy wiatry wyrywają i niszczą drzewa.
Burza sztormowa i znaczne opady deszczu łączą się z silnymi wiatrami, aby zagrozić zapasowi żywności dostępnemu dla pozostałych zwierząt, które nie zostały zabite przez burzę. Kiedy huragan Hugo uderzył w Puerto Rico w 1989 roku, połowa pozostałych portorykańskich papug na świecie zginęła w czasie burzy. Cozumel Thrasher, który żyje tylko na meksykańskiej wyspie Cozumel, prawie wyginął po uderzeniu huraganu Gilbert na wyspę w 1988 roku.
Huragany zmieniają również kształt przybrzeżnych krajobrazów, przesuwając ogromne ilości piasku. Huragany w latach 2004, 2005 i 2008 spowodowały duże zmiany na wybrzeżu Zatoki Meksykańskiej; między huraganami Katrina i Rita, które trafiły w 2005 r., około 73 mil kwadratowych ziemi zostało utraconych w stosunku do morza.
