Komórki działają podobnie do fabryk, które pobierają surowce i zużywają energię do produkcji odpadów i gotowych produktów. W przypadku komórki gotowe produkty to białka, które można wykorzystać w budownictwie i operowanie ciałem.
Oprócz funkcjonalnych podobieństw między nimi, komórki również przypominają budowle strukturalne i wspólnotowe. Zewnętrzna membrana plazmowa komórki jest analogiczna do ścian fabryki, a jej wewnętrzne rozmieszczenie organelli jest w przybliżeniu podobne do wewnętrznych ścianek działowych, które oddzielają warsztat fabryczny i malarnię. Analogia podziału wewnętrznego rozkłada się jednak, ponieważ większość ogniw pozwala na swobodne mieszanie się składników chemicznych, co jest jak fabryka, w której mechanicy i pracownicy linii zajmują te same miejsca pracy, co personel i kierownictwo.
Komórki są również podobne do fabryk, ponieważ są jednostkowymi jednostkami produkcji i konsumpcji w kontekście znacznie większej gospodarki. Podobnie jak fabryki są odizolowanymi miejscami działalności gospodarczej, które są połączone z innymi fabrykami i ich rynkami w większej społeczności, komórki są pogrupowane w typy tkanek i wyspecjalizowane organy. Organy są z kolei zorganizowane w systemy wewnątrz ciała. W każdym przypadku małe jednostki współpracują ze sobą, aby płynnie uzyskać większą całość funkcji.