Po kolonoskopii florę jelitową można przywrócić, przyjmując zarówno prebiotyki, jak i probiotyki, aby przywrócić zdrowy poziom flory jelitowej, zgodnie z Gut Sense. Przyjmując te doustne suplementy, pacjent skutecznie ponownie zaszczepia jelita grubego nową ilością bakterii, aby ułatwić trawienie i eliminację.
Uważane za doustną terapię bakteryjną, prebiotyki i probiotyki są niedrogim środkiem do przywrócenia zdrowia jelit po kolonoskopii, według Gut Sense. Suplementy te można przyjmować regularnie lub w razie potrzeby w celu promowania lepszego trawienia pokarmu. W zależności od rodzaju użytych prebiotyków i probiotyków, mogą one wymagać przyjmowania z posiłkiem lub bez posiłku.
Chociaż wiele produktów spożywczych, takich jak jogurt, reklamuje się, aby przywrócić regularność, w rzeczywistości nie są one zgodne z Gut Sense. Aby zachować termin przydatności do spożycia i jakość tych produktów, większość dostępnych w handlu produktów przechodzi pasteryzację, która zabija żywe bakterie. W przypadku jogurtu lub innych produktów probiotycznych, które nie są pasteryzowane, większość bakterii w nich jest zabijana w żołądku, nigdy nie trafia do jelita grubego. Suplementy mają pozostać nieaktywne w żołądku i aktywować w jelicie grubym, gdzie mogą ponownie zaludnić jelitami zdrowymi bakteriami.