Miejscowa mikroflora definiowana jest jako wspólnota drobnoustrojów żyjących na lub w innym żywym organizmie lub w określonym środowisku. Do mikroorganizmów należą bakterie, algi i grzyby.
Zdrowa tkanka zwierzęca, taka jak krew i mięśnie, jest normalnie wolna od mikroorganizmów, ale jest wiele miejsc w zdrowym organizmie, w którym mikroorganizmy są zawsze obecne, w tym skóra, błony śluzowe i jelita. traktat. Ta normalna flora, zwana także "rodzimą mikrobiotą", nie jest z natury patogenna i, w większości przypadków, przynosi korzyści gospodarzowi. W większości przypadków związek między żywicielem a jego florą można opisać jako "mutualistyczny". Podczas gdy gospodarz zapewnia bakteriom stały dopływ substancji odżywczych i ochronę przed środowiskiem, bakterie wspomagają proces trawienny gospodarza i pomagają chronić gospodarza przed zakażeniem przez drobnoustroje chorobotwórcze.
Mikroby zamieszkujące przeciętne zdrowe ludzkie ciało reprezentują ogromną liczbę komórek. Ciało ludzkie składa się z około 10 bilionów komórek, ale według magazynu Discover liczba komórek bakteryjnych, w których znajduje się organizm, jest bliższa 100 bilionów lub dziesięć razy więcej. Jednakże, ponieważ komórki bakterii są tak małe, że cała populacja drobnoustrojów napełniłaby tylko pół galonowy dzbanek.