Istnieje wiele różnic między szczurami i myszami, takich jak rozmiar, zachowanie i kształt ich pysków. Myszy mają zazwyczaj długość od 4 do 8 cali, w tym ich ogony, z pyskami o kształcie trójkąta. Szczury mają tępe pyski i są znacznie większe, rosną prawie do 16 cali.
Różnica między szczurami i myszami wykracza poza cechy fizyczne. Naukowcy odkryli, że obie gryzonie mają bardzo różne cechy behawioralne. Szczury wykazują większą ostrożność, podczas gdy myszy wydają się być ciekawe i badają otoczenie. Szczury potrzebują czasu, aby przyzwyczaić się do otoczenia. To wyjaśnia, dlaczego mysz jest złapana znacznie szybciej niż szczur, gdy pułapka jest ustawiona.
Myszy są również w stanie rozmnażać się częściej niż szczury. Samica myszy może rodzić 10 razy w roku, podczas gdy samica szczurów ma tylko sześć okresów ciąży. Jednak szczury mają tendencję do dłuższego życia, do 1,5 roku, podczas gdy średnia długość życia myszy wynosi od 9 do 12 miesięcy.
Myszy bardzo boją się szczurów i nie zamieszkują tego samego obszaru z obawy przed zjedzeniem. Szczury wydzielają zapach, który nie tylko ostrzega mysz, że szczur jest w pobliżu, ale także ma negatywny wpływ na reprodukcję i zachowanie myszy.