Ameby wywołują choroby, takie jak ameboidalna czerwonka, ameboiczne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, ameboza i amebowy ropień wątroby. Niektóre z tych zaburzeń mają objawy, które są ciche lub łagodne. Inne zagrażają życiu.
Amoebiczna czerwonka jest spowodowana spożywaniem pokarmu lub wody pitnej, która została zanieczyszczona amebicznymi cystami znajdującymi się w ściekach surowych. Objawem tej choroby jest krwawa, wybuchowa i cuchnąca biegunka. Biegunka może być taka, że pacjent również odczuwa odwodnienie. Pacjent może również odczuwać gorączkę, zmęczenie, dreszcze, utratę wagi i silne bóle brzucha.
Jeśli amoebiczna czerwonka nie jest leczona, ameby mogą być przenoszone do wątroby, gdzie mogą powodować ropnie. Objawy są takie same jak w przypadku czerwonki pełzakowej, chociaż pacjent cierpi również na żółtaczkę i powiększoną wątrobę. Amoebazja jest również powodowana przez ameby, ale objawy mogą być łagodne lub nawet ciche.
Amoebiczne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych jest rzadką, ale straszną chorobą wywołaną przez Naegleria fowleri ameba. W tej chorobie ameby atakują centralny układ nerwowy. Pierwsze objawy to utrata zmysłu węchu. Objawy następnie przechodzą do objawów zapalenia mózgu, które są sztywnymi mięśniami szyi, bólem głowy, nudnościami, drgawkami, majaczeniem i śpiączką, które mogą przejść na śmierć.