Rośliny, które żyły w erze mezozoicznej to cykady, cycadeoidy, ginkgoity, ginkofity, drzewa iglaste, glossopteridy i okrytonasienne. Na początku ery mezozoicznej dominowały rośliny nagonasienne. Pod koniec epoki pojawiły się okrytonasienne.
Epoka mezozoiczna podzielona jest na trzy okresy, w których powstało wiele różnych rodzajów roślin. W pierwszych dwóch okresach, okresie triasu i jury, pojawiły się nagonasienne rośliny, które nie mają nasion w swoich kwiatach, takich jak sosny. W okresie triasu 20 procent światowej flory stanowiły cykady. Obecnie na świecie pozostało tylko kilka gatunków cykad. Glossopterids kwitły w tym czasie, chociaż wymarły przed okresem jury.
W okresie jurajskim cykady wciąż kwitły, mając wiele cech współczesnych paproci. Cykladydy rozwinęły się również w okresie jury, a rośliny te przypominały cykady, ale miały wyraźne różnice w rozrodczości. Ginkgofity, które rozpoczęły się tuż przed mezozoikami, zaczęły urozmaicać 11 różnych gatunków. Drzewa iglaste również zaczęły rosnąć i rozprzestrzeniać się.
W ostatnim okresie ery mezozoicznej, w okresie kredowym, pojawiły się okrytonasienne rośliny lub rośliny kwitnące. Obecnie większość roślin na Ziemi jest klasyfikowana jako okrytonasienne.
