Główne cechy geograficzne Kolumbii to rzeka Magdalena, rzeka Cauca, rzeka Amazonka, rzeka Orinoko, góry Santa Marta i pasmo górskie Andów, podzielone na trzy regiony: Cordillera Occidental, Cordillera Oriental i Cordillera Central . Stolica Bogoty znajduje się na wzniesionym płaskowyżu w północnej części Andów.
Kolumbia jest jedynym krajem w Ameryce Południowej, który ma terytoria nadbrzeżne zarówno na Oceanie Spokojnym, jak i na Morzu Karaibskim. Jego ogólny teren jest górzysty z ośnieżonymi szczytami z widokiem na silnie zalesione tereny i łąki. Inne cechy fizyczne w Kolumbii to Góry Baudo, Góry Perija, Rzeka Putumayo i Tarcza Gujany.