Grzyby saprotroficzne pochłaniają substancje odżywcze z rozkładającej się materii organicznej. Uwalniają kwasy i enzymy, które rozkładają martwą tkankę na mniejsze cząsteczki, dzięki czemu mogą zostać wchłonięte. Grzyby te są niezwykle ważne dla łańcucha pokarmowego, ponieważ pomagają odzyskać martwą materię z powrotem do gleby.
Zachowanie saprotroficzne jest jednym z czterech sposobów, w jaki grzyby uzyskują składniki odżywcze. Grzyby borowikowe tworzą symbiotyczne związki z innymi roślinami i zwierzętami. Zwykle związek jest mutualistyczny, co oznacza, że oba organizmy odnoszą korzyści. Grzyb tka się wokół komórek korzeni rośliny lub owija się wokół samych korzeni. Grzyb dostarcza dodatkowej wilgoci i składników odżywczych do rośliny, a z kolei uzyskuje dostęp do cukrów, które roślina produkuje. Grzyby endofityczne tworzą również mutualistyczną relację z rośliną gospodarza. Mają jednak swoją własną kategorię, ponieważ w przeciwieństwie do grzybów myroryzowych można je łatwo hodować w laboratorium bez obecności rośliny żywicielskiej. Grzyby pasożytnicze infekują i żywią się żywymi organizmami, ostatecznie zabijając je.